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在分子生物学中，电泳实验是核酸的分离、纯化及蛋白识别的有效方法，可以与凝胶成像系统配合使用，也可以单独使用，具体根据实验目的来选择。琼脂糖凝胶电泳是通过DNA片段在琼脂糖介质电场中的电泳速率大小来判断 DNA分子量的大小的实验方法。
琼脂糖凝胶中常用的染料有哪些？
1.溴化乙锭 ：溴
化乙锭通常习惯简称“EB”，是核酸染色及凝胶成像分析中普遍使用的染料。
EB染料属于核酸分子嵌入型染色剂，且具有DNA诱导突变的作用。研究发现，长期使用溴化乙锭或长期处在含溴化乙锭的实验环境中，会对人体造成较大的伤害，甚至增加遗传方面的致畸率 。所以在实验室中，使用EB类染料时要做好全套防护，实验后的废液、耗材等也要严格管理，切勿随意丢弃，以防对他人造成间接伤害。
2.吖啶橙染料：吖啶橙染料（Goldview）主要用于RNA 染色、荧光染色以及细胞凋亡实验等，从理论上讲虽然Goldview染料的毒性远远低于 EB，但是在实验室也不可粗心大意。
3. GelGreen荧光染料与 Gelred核酸染料
GelRed 和GelGreen 都属于荧光核酸染料，其中Biotium的市场份额较大，在化学发光、凝胶成像、电泳等相关实验中应用较为普遍。 由于Gelred和GelGreen的分子量较大，且具有特殊的油性分子，很难渗透细胞膜进入动物细胞内，所以这种染料相对较为安全，实验后的废弃物对周边环境的危害性也较小，可放心使用。
4. SYBR Green染料 和SYBR Gold染料
SYBR Green与SYBR Gold具有灵敏度好，成本低廉，毒性低，信噪比较高，并且实验时无需进行洗脱操作等特点，广泛应用于凝胶电泳分析实验中。但是作为花箐素类核酸染料其稳定性较差，在一定光诱导下也会产生强诱变力，易造成DNA序列上的基因位点突变。
常用的这几种核酸染料相信每个实验室都使用过，但是对于核酸染料的危害也要注意，实验中做好实验防护也很关键。
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